為了確保移液器的準確度和度，應根據具體使用情況進行定期保養。特別是在使用腐蝕性溶劑后，應該對移液器進行清潔。通過這些簡單的清潔和保養方法，可適當地延長移液器的使用壽命。
水溶液和緩沖液：打開移液器，用雙蒸水沖洗污染的部分，可以在干燥箱中干燥，溫度不*過60~C。給活塞涂抹少量潤滑油；
無機酸/堿：移液器中使用的塑料材料和陶質活塞大都是耐酸耐堿材料（除了氫氟酸）。但酸／堿液的蒸氣可能會進入移液器的下部，影響其性能，清潔方法同“水溶液”部分；
具有潛在傳染性的液體：對污染的部分進行121~C、20min高壓滅菌，或者將移液器下部浸入實驗室常規的消毒劑中。隨后用雙蒸水清洗，并用上述方法進行干燥；
有機溶劑：通常對于蒸氣壓高的液體，任其自然揮發的過程就足夠了，或者將下部浸人消毒劑中（確保浸人的液面不要*過密封圈彈簧位置，以避免受到液體腐蝕）。用雙蒸水清洗，并用上述干燥方法將其干燥；
放射性溶液：拆開移液器，將污染部分浸入復合溶液或的清潔溶液，用雙蒸水清洗，并用上述干燥方法將其干燥；
核酸／蛋白質溶液：拆開移液儀，用去污劑清洗，清洗和干燥方法如上所述核酸，在氨基乙酸／鹽酸緩沖液（pH2．0）中煮沸10分（確保瓊脂糖凝膠電泳檢測不到DNA殘留），用雙蒸水清洗干凈，并用上述的干燥方法干燥，同時給活塞涂抹少量潤滑油。
